Exame » SEQUENCIAMENTO DOS GENES BRCA1 E BRCA2 [706530]

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Este teste sequencia todos os exons e splice sites dos genes BRCA1 e BRCA2. Mutações nesses genes supressores tumorais estão relacionadas com risco aumentado para desenvolvimento de câncer de mama e câncer de ovário. A identificação dos portadores desse risco genético permite o desenvolvimento de um plano de prevenção personalizado, diferente da população geral. Esse teste não avalia grandes deleções e duplicações nesses dois genes. Essa análise pode ser feito no teste BRCATotal, ou solicitando-se o teste de MLPA desses genes, separadamente.

Realizado por:

Genomika

Prazo *: 20 dias corridos O prazo é contado a partir da chegada da amostra no laboratório executor

Genes Analisados

Painel de Genes Analisados: (2 genes)

BRCA1 NM_007294 BRCA2 NM_000059

Observações:

BRCA2: É realizada a PCR seguida de eletroforese em gel de agarose do exon 3 de BRCA2 para pesquisa da inserção ALU.

Pseudogenes

As seguintes regiões apresentam pseudogenes, o que limita a qualidade da chamada de variantes nessas regiões e, portanto, resultados não confiáveis não serão relatados.

BRCA1: Pseudo-gene no(s) exon(s):2

Documentos Obrigatórios

Formulário de Requisição Termo de Consentimento

Instruções

Exigência	Descrição
Materiais	Sangue ou Saliva ou DNA extraído (para envio, entrar em contato com a Genomika)
Conservantes	Sangue em EDTA Kit Saliva OCR-100 (ORAcollect) ou OG-500 (Oragene)
Volume Recomendável	Sangue: mínimo 2 ml, ideal 4 ml Saliva: mínimo de 1,5 a 2 mL
Tempo de Jejum	Jejum não obrigatório
Conservação	Sangue em tubo com EDTA (tampa roxa): enviar a amostra num prazo máximo de 96h (temperatura ambiente, 18-25ºC) ou 7 dias (refrigerada, 2-8ºC). Saliva em tubo OCR-100 (ORAcollect) ou OG-500 (Oragene): enviar a amostra num prazo máximo de 15 dias (temperatura ambiente, 18-25ºC ou refrigerada, 2-8ºC), por courier.
Critérios de Rejeição	Amostra de sangue congelada. Presença de coágulo ou hemólise grosseira. Amostra coletada por mais de 96 horas. Quantidade de amostra insuficiente. Avarias no tubo e/ou recipiente do material enviado. Tubo com anticoagulante ou conservante inadequado. Amostra sem identificação. Falta de requisição médica ou do termo de consentimento assinado pelo paciente ou responsável. Se a amostra for DNA extraído, é obrigatório o envio do formulário específico (entrar em contato com atendimento previamente).
Última Atualização	04/11/2019
Documentos Obrigatórios	Formulário de Requisição Termo de Consentimento

Metodologia

A metodologia usada no exame é NGS- Sequenciamento de Segunda Geração por Multiplex.

O DNA é extraído de sangue periférico ou saliva de forma automatizada (QIASymphony). A técnica principal para o preparo da biblioteca de DNA é utilizando-se a tecnologia de PCR multiplexado com molecular barcode (QiaSeqDNA V3). Caso existam regiões não adequadamente cobertas na primeira técnica, é preparada por PCR convencional seguido de Nextera ou Sanger. O sequenciamento de segunda geração é realizado na plataforma Illumina e o sequenciamento de Sanger é realizado em um sequenciador automático ABI 3500. O resultado final é uma cobertura de 100% das bases com profundidade acima de 50x nos exons e 5pb de região intrônica adjacente. A chamada de variante é feita através do transcrito de referência a partir da base A do códon de iniciação ATG alinhado contra o genoma de referência GRCh37/hg19. Adicionalmente é realizada a PCR seguida de eletroforese em gel de agarose do exon 3 de BRCA2 para pesquisa da inserção ALU.

Limitações do exame

- Este teste detecta pequenas deleções e duplicações até 17 bp, mas grandes deleções e duplicações não são detectadas por esta metodologia. Outras alterações estruturais,como inversões e translocações também não são detectadas. Havendo suspeita de algumas destas alterações, pode-se usar metodologias como array CGH, MLPA, qPCR ou FISH. - Mutações por expansão de repeats de trinucleotídeos não são detectáveis por sequenciamento. - Mutações intrônicas profundas ou em regiões regulatórias, como promotores, não são detectáveis no presente teste. - Alteração epigenéticas não são detectáveis por este teste.

Doenças relacionadas

Código	Descrição	Detalhes
MAMA	CÂNCER DE MAMA E OVÁRIO HEREDITÁRIOS	ver mais
CODE-17	CÂNCER DE OVÁRIO	ver mais

Outros nomes para SEQUENCIAMENTO DOS GENES BRCA1 E BRCA2

BRCA
BRCA2 EXON 3 ALU
Câncer de Mama
Câncer de Ovário
genes BRCA1 e BRCA2
PAINEL GENÉTICO

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